深圳铁路集装箱中心站项目是全国铁路集装箱“十五”发展规划首批建设的18个集装箱中心站之一，位于深圳平湖南编组站东侧（平湖物流园范围），项目投资估算总额为7.5亿元，铁道部于2005年8月批复了项目工可，目前项目初步设计审查工作已完成，预计2007年建成投入使用。尽快建成该中心站，既是适应地区经济和对外贸易发展的需要，也是顺应现代物流发展、增强铁路的市场竞争力、促进社会资源合理配置的需要。建设深圳铁路集装箱中心站不仅对于构建全路集装箱中心站网络有重要意义，而且对扩大深圳作为国际航运中心的辐射能力和服务功能也有重要作用。
根据中心站规划，铁路集装箱中心站具备如下几项功能：
1、具备办理集装箱列车及枢纽集装箱小运转列车的到发和整列集装箱列车装卸的功能；
2、具备办理国际集装箱联运业务的口岸功能；
3、具备办理集装箱多式联运及门到门服务的功能；
5、具备集装箱储存和空箱调配的功能；
6、具备铁路运输和站内集装箱信息处理和传输的功能。
